Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP3Q96DZ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms