Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms