Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms