Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF428Q96B54 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms