Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP9XQ93008 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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