Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms