Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms