Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HELBQ8NG08 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms