Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms