Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG16L2Q8NAA4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L2Q8NAA4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms