Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms