Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms