Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8AQ86V59 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8AQ86V59 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8AQ86V59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8AQ86V59 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8AQ86V59 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA8AQ86V59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms