Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HAPLN4Q86UW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms