Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG9AQ7Z3C6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms