Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms