Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC29A4Q7RTT9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC29A4Q7RTT9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms