Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAXIP1Q6ZW49 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms