Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms