Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALS2CLQ60I27 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALS2CLQ60I27 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms