Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms