Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF648Q5T619 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms