Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6CQ53S08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms