Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL22Q53GT1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms