Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms