Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms