Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRFIP1Q32MZ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms