Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC27Q2M243 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms