Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms