Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNRD1Q16881 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms