Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NDUFA9Q16795 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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