Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC37Q16543 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms