Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC1Q15915 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms