Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ZFHX3Q15911 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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