Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8Q15843 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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