Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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