Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms