Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCAPHQ15003 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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