Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL19A1Q14993 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL19A1Q14993 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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