Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSPNQ14714 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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