Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H2Q13888 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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