Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P11Q13670 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms