Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL4AQ13619 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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