Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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