Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XRCC4Q13426 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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