Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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