Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms