Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K1Q13233 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K1Q13233 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms