Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACACAQ13085 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms