Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXC1Q12948 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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